Juntando os dois episódios da trilogia Star Wars para trás, o jogo concentra-se na história baseada na série de desenho animado homônimo da LucasArts empresa. Graphics core no Clone Wars é a mesma em produtos de jogos anteriores, emitidas sob o logotipo da Lego. Todas as projeções o mesmo de um terceiro, no qual você controla um brinquedo encarnações dos personagens familiares a qualquer fã de Star Wars. O script deve ser um resumo da história contada em um episódio de uma trilogia, a série animada homônima. Tudo o que você tem que fazer – pegar itens úteis, a solução de enigmas e quebra-cabeças, batalhas com o inimigo usando todo tipo de super-poderes – bem típico para produtos da série de jogos Lego.